ژنتیک اصلاح و ویرایش ژن
بر پایه‌ی ۷ منبع علمی

ویرایش ژن چطور انجام می‌شه؟

رشته‌ی راهنما و قیچی مولکولی کریسپر روی مارپیچ دی‌ان‌ای که هر دو رشته رو توی یه نقطه می‌برن
۴ دقیقه کاوش آخرین به‌روزرسانی: ۹ آبان ۱۴۰۵
مفهوم‌های این کاوش دی‌ان‌ای کریسپر رشته‌ی راهنما
این کاوش را چطور دوست داری دنبال کنی؟ ۴ ارائه‌ی دیگر در راه‌اند
روخوانی نوشتار هنوز آماده نیست
به‌زودی

پاسخ کوتاه ویرایش ژن یعنی عوض کردن یه تکه‌ی مشخص از دی‌ان‌ای، همون متن بلندی که توی سلول‌های ما نوشته شده. پژوهشگرها یه رشته‌ی راهنما می‌سازن که جای درست رو توی این متن پیدا می‌کنه و یه قیچی مولکولی رو به اون‌جا می‌رسونه تا دی‌ان‌ای رو ببره. این ابزار، که اسمش کریسپره، فقط می‌بره. خودِ ویرایش رو سلول انجام می‌ده، موقع ترمیم همون برش: یا چند حرف جا می‌افته و ژن خاموش می‌شه، یا تکه‌ی تازه‌ای که بهش دادیم جای تکه‌ی قبلی رو می‌گیره.

این قیچی رو باکتری‌ها ساختن

برات پیش اومده یه پیام بنویسی و درست قبل از فرستادن ببینی یه حرفش غلطه؟ خیلی‌هامون با شنیدن «ویرایش ژن» همین صحنه میاد جلوی چشممون. دی‌ان‌ای متن بلندیه که توی سلول‌های ما نوشته شده و ژن‌ها تکه‌هایی از همین متن هستن. ولی این متن صفحه‌کلید نداره. پس چطور می‌شه به یه نقطه‌ی مشخصش دست زد؟

جوابش از دنیای باکتری‌ها اومد. باکتری‌ها هم دشمن دارن، ویروس‌هایی که بهشون حمله می‌کنن. باکتری یه تکه از دی‌ان‌ای ویروس مهاجم رو می‌بره و توی دی‌ان‌ای خودش نگه می‌داره، مثل حافظه‌ای از دشمن‌های قبلیش. اگه همون ویروس برگرده، باکتری از روی این حافظه رشته‌های کوتاهی می‌سازه که به دی‌ان‌ای ویروس می‌چسبن، و بعد یه قیچی مولکولی اون دی‌ان‌ای رو دو تکه می‌کنه. ویروس هم از کار می‌افته.

امانوئل شارپانتیه و جنیفر دودنا همین دستگاه رو توی لوله‌ی آزمایش بازسازی کردن و نشون دادن می‌شه هدفش رو عوض کرد، طوری که هر مولکول دی‌ان‌ای رو درست جایی ببره که از قبل تعیین شده. همین کار براشون جایزه‌ی نوبل شیمی رو آورد. ما به این ابزار می‌گیم کریسپر.

یک واژه کریسپر (CRISPR) ابزار ویرایش ژنی که از دستگاه دفاعی باکتری‌ها برداشته شده و دی‌ان‌ای رو توی جای تعیین‌شده می‌بره.

راهنما نشونه می‌گیره، قیچی می‌بره

فرض کن یه پژوهشگر می‌خواد یه تکه‌ی مشخص از دی‌ان‌ای رو عوض کنه. اول یه رشته‌ی راهنما می‌سازه، رشته‌ی کوتاهی که متنش قرینه‌ی همون تکه‌ست. این راهنما هم به قیچی می‌چسبه و هم جای درست رو پیدا می‌کنه. یعنی نشونه‌گیری کار راهنماست، نه کار قیچی.

پس می‌شه هر جایی رو هدف گرفت؟ نه هر جایی رو. قیچی فقط جایی می‌تونه بشینه که یه نشونه‌ی کوتاه کنار هدف باشه. برای همین بخشی از طراحی این کار، پیدا کردن هدفیه که این نشونه رو کنارش داشته باشه.

دی‌ان‌ای از دو رشته‌ی کنار هم درست شده. وقتی راهنما به جای درست رسید، قیچی هر دو رشته رو توی یه نقطه می‌بره و دو سر صاف به جا می‌ذاره. کارش همین‌جا تموم می‌شه. متوجه شدی تا این‌جا هیچ حرفی از متن عوض نشده؟ متن فقط یه جاش بریده شده.

راهنما با تکه‌ای از دی‌ان‌ای جور می‌شه که متنش قرینه‌ی خودشه، و قیچی اون‌جا هر دو رشته رو توی یه نقطه می‌بره. ولی قیچی فقط جایی می‌شینه که یه نشونه‌ی کوتاه کنار هدف باشه؛ توی قاب پایین همون هدف بدون نشونه‌ست و برشی نمی‌خوره. این شکل یه طرح ساده‌ست.
یک واژه رشته‌ی راهنما (guide RNA) رشته‌ی کوتاهی که متنش قرینه‌ی تکه‌ی هدفه و جای برش رو به قیچی نشون می‌ده.

ویرایش رو خودِ سلول انجام می‌ده

چیزی که بعد از برش متن رو عوض می‌کنه ابزار نیست، دستگاه ترمیم خودِ سلوله. سلول دو راه داره.

راه اول اینه که دو سر بریده رو سریع به هم بدوزه. این دوخت معمولاً بی‌نقص نیست. چند حرف جا می‌افته یا اضافه می‌شه و متن ژن به هم می‌خوره. همین خرابی کوچیک راه معمول خاموش کردن یه ژنه.

راه دوم وقتیه که یه تکه‌ی سفارشی هم به سلول داده باشن. اون‌وقت سلول تکه‌ی قبلی رو با این تکه‌ی تازه عوض می‌کنه. این یکی بیشتر شبیه همون درست کردن غلط پیامه.

ابزار فقط دی‌ان‌ای رو می‌بره و تا این‌جا هیچ حرفی عوض نشده. بعدش نوبت سلوله. یا دو سر رو سریع به هم می‌دوزه و معمولاً چند حرف جا می‌افته یا اضافه می‌شه؛ چه کم بشه چه زیاد، حرف‌های بعدش دیگه سر جاشون نیستن، متن ژن به هم می‌خوره و ژن خاموش می‌شه. یا اگه یه تکه‌ی سفارشی بهش داده باشن، اون رو جای تکه‌ی قبلی می‌ذاره. علامت‌ها نماد حرف‌های دی‌ان‌ای هستن و این شکل یه طرح ساده‌ست.

ابزار فقط می‌بره؛ ویرایش کار خودِ سلوله.

بیمارهای پیگیری‌شده ۲۹ از ۳۱ از سی‌ویک بیماری که به اندازه‌ی کافی پیگیری شدن، بیست‌ونه نفر دست‌کم یه سال کامل بدون حمله‌ی درد شدید موندن.

از لوله‌ی آزمایش تا بدن آدم

اولین دارویی که با این روش ساخته شد، دسامبر ۲۰۲۳ توی آمریکا برای کم‌خونی داسی‌شکل تأیید شد. پزشک‌ها سلول‌هایی رو که خون بیمار رو می‌سازن بیرون از بدن ویرایش می‌کنن تا نوعی پروتئین خون بسازن که گلبول‌ها رو داسی نکنه، و بعد اون‌ها رو به بدن خودش برمی‌گردونن. پیگیری درازمدت این بیمارها هنوز ادامه داره.

ولی این ابزارها گاهی جای اشتباه رو می‌برن، و مؤسسه‌ی ملی پژوهش ژنوم انسان آمریکا می‌گه هنوز معلوم نیست این برش‌ها برای بیمار چه معنایی داره. برای همین سنجش ایمنی پیش از درمان قدم کلیدیه. مرز دیگه‌ای هم هست. ویرایش سلول‌های معمولی بدن به فرزند نمی‌رسه، ولی ویرایش تخمک، اسپرم یا جنین به نسل‌های بعد می‌رسه. این دومی توی آمریکا و خیلی از کشورهای دیگه غیرقانونیه و نشست جهانی ویرایش ژن هم اون رو «در حال حاضر غیرقابل‌قبول» خوند. حالا که به این متن می‌شه دست زد، ما دلمون می‌خواد این مرز کجا بمونه؟

توی ویرایش ژن، یه رشته‌ی راهنما جای درست دی‌ان‌ای رو پیدا می‌کنه، یه قیچی اون‌جا رو می‌بره و دستگاه ترمیم خودِ سلول متن رو عوض می‌کنه.

چرا این پرسش مهم است دفعه‌ی بعد که خبر «ژن‌ها رو اصلاح کردن» رو می‌شنویم، می‌دونیم چی بپرسیم. برش کجا خورده، توی کدوم سلول انجام شده و به نسل بعد هم می‌رسه یا نه؟

این پاسخ از کجا آمده

هر چیزی که بالا خواندی از این ۷ منبع بیرون آمده. اگر خواستی خودت سرچشمه را ببینی، لینک‌ها همین‌جاست.

۷ منبع
۱ The Nobel Prize in Chemistry 2020 — Genetic scissors: a tool for rewriting the code of life (Royal Swedish Academy of Sciences) بخش اول، بازسازی دستگاه دفاعی باکتری در لوله‌ی آزمایش و عوض کردن هدفش، و جایزه‌ی نوبل نهاد رسمی ۲ What are genome editing and CRISPR-Cas9? (MedlinePlus Genetics, NIH) بخش اول، دوم، سوم و چهارم، حافظه‌ی باکتری، نقش رشته‌ی راهنما، کار ترمیم سلول، و فرق سلول‌های معمولی با تخمک و اسپرم و جنین نهاد رسمی ۳ Questions and Answers about CRISPR (Broad Institute) بخش دوم و سوم، نشانه‌ی کنار هدف، برش هر دو رشته با دو سر صاف، و خاموش شدن ژن با دوخت سریع نهاد رسمی ۴ What is Genome Editing? (NHGRI) بخش چهارم، برش‌های ناخواسته و اهمیت سنجش ایمنی نهاد رسمی ۵ FDA Approves First Gene Therapies to Treat Patients with Sickle Cell Disease (FDA, 2023) بخش چهارم، اولین داروی تأییدشده، روش درمان و نتیجه‌ی بیمارها نهاد رسمی ۶ Statement from the Organising Committee of the Third International Summit on Human Genome Editing (Royal Society, 2023) بخش چهارم، موضع نشست جهانی درباره‌ی ویرایش ارث‌بردنی و ویرایش سلول‌های معمولی نهاد رسمی ۷ Breakthrough DNA Editor Born of Bacteria (Quanta Magazine, 2015) بخش اول، دستگاه دفاعی باکتری‌ها در برابر ویروس رسانه‌ی علمی